经过多年的建设，云南中医学院中医儿科学学科已成为师资队伍合理，知识结构优化，具有较强学术基础和发展潜力的优势学科，成为集教学、临床、科研于一体的重要基地。学科立足于继承与创新，在中医特色、学术水平，临床能力以及人员、设备及管理方面，均处于西部领先地位，在国内同类学科中占有一席之地。本学科特色和优势主要表现在以下个方面：
1.针对云南地区小儿发病特点和利用云南资源优势，在中西医结合治疗小儿肺系疾病、小儿过敏性疾病、小儿心理行为异常性疾病及儿科用药剂型改革、预防保健等方面凸显特色，形成了稳定的研究方向。
2、采用多种方法、多种途径、多个环节治疗小儿肺系疾病、过敏性疾病和心理行为异常性疾病，尤其对小儿肺脾疾病、过敏性紫癜已形成一整套较为成熟实用的诊疗规范，并在总结应用名老中医经验基础上，与多学科交叉进行相关基础与临床研究。
3、重视儿科剂型改革研究，研制十余种特色医院制剂在云南省中医医疗集团所辖近百家医院内广泛使用，产生了较大的经济效益和难以估量的社会效益；并在创新儿科外治法方面进行探索，对中药香薰油、微球吸入剂、防治肺系疾病的研究独树一帜。